CPLP-TB:: uma nova ferramenta de vigilância transnacional da tuberculose no espaço lusófono

João Perdigão; Carla Silva; Jaciara Diniz; Catarina Pereira; Diana Machado; Jorge Ramos; Hugo Silva; Fernanda Abilleira; Clarice Brum; Ana J Reis; Maíra Macedo; João L Scaini; Ana B. Silva; Leonardo S. Esteves; Rita Macedo; Fernando Maltez; Sofia Clemente; Elizabeth Coelho; Sofia Viegas; Paulo Rabna; Amabélia Rodrigues; Nuno Taveira; Luísa Jordão; Afrânio Kritski; José Roberto Lapa E Silva; Igor Mokrousov; David Couvin; Nalin Rastogi; I Couto; Arnab Pain; Ruth McNerney; Taane G. Clark; Andrea von Groll; Elis R. Dalla Costa; Maria Lúcia Rossetti; Pedro E Almeida da Silva; M Viveiros; Isabel Portugal

doi:https://doi.org/10.25761/anaisihmt.278

CPLP-TB: uma nova ferramenta de vigilância transnacional da tuberculose no espaço lusófono

Translated title of the contribution: CPLP-TB:: a new tuberculosis transnational surveillance tool for the lusophone community

João Perdigão, Carla Silva, Jaciara Diniz, Catarina Pereira, Diana Machado, Jorge Ramos, Hugo Silva, Fernanda Abilleira , Clarice Brum, Ana J Reis, Maíra Macedo, João L Scaini, Ana B. Silva , Leonardo S. Esteves, Rita Macedo, Fernando Maltez, Sofia Clemente, Elizabeth Coelho, Sofia Viegas, Paulo RabnaAmabélia Rodrigues, Nuno Taveira, Luísa Jordão, Afrânio Kritski, José Roberto Lapa E Silva, Igor Mokrousov, David Couvin, Nalin Rastogi, I Couto, Arnab Pain, Ruth McNerney, Taane G. Clark, Andrea von Groll, Elis R. Dalla Costa, Maria Lúcia Rossetti, Pedro E Almeida da Silva, M Viveiros, Isabel Portugal

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Abstract

A Tuberculose (TB) permanece um grave problema de saúde pública na Comunidade dos Países de Língua Portuguesa (CPLP). Apesar da ampla variância da incidência da TB nos seus estados-membro e de um fluxo migratório contínuo entre os países que integram este grupo, existe uma enorme lacuna no que diz respeito ao conhecimento da estrutura populacional conjunta do Mycobacterium tuberculosis e circulação de estirpes entre estes países. Para fazer face a esta necessidade, foi agregado e analisado o maior conjunto de dados respeitante à diversidade genotípica e resistência fenotípica na CPLP que compreende um total de 1447 isolados clínicos, incluindo 423 isolados multirresistentes de cinco países da CPLP. Por forma a tornar estes dados disponíveis para a comunidade científica e autoridades de saúde pública, foi desenvolvida a CPLP-TB (disponível em http://cplp-tb.ff.ulisboa.pt), uma base de dados disponível online e provida de aplicativos para análise exploratória do conteúdo. Como ferramenta de saúde pública, espera-se que venha a contribuir para um conhecimento mais aprofundado da estrutura populacional do M. tuberculosis e circulação de estirpes na CPLP de forma a apoiar a avaliação de risco e tendências específicas para diversos clones.

Tuberculosis (TB) remains a major health problem within the Community of Portuguese Language Speaking Countries (CPLP). Despite the marked variation in TB incidence across its member-states and continued human migratory flux between countries, a considerable gap in the knowledge on the Mycobacterium tuberculosis population structure and strain circulation between the countries still exists. To address this, we have assembled and analyzed the largest CPLP M . tuberculosis molecular and drug susceptibility dataset, comprised by a total of 1447 clinical isolates, including 423 multidrug-resistant isolates, from five CPLP countries. To make this data available to the scientific community and public health authorities we developed CPLP-TB (available at http://cplp-tb.ff.ulisboa.pt), an online database coupled with web-based tools for exploratory data analysis. As a public health tool, it is expected to contribute to improved knowledge on the M. tuberculosis population structure and strain circulation within the CPLP, thus supporting the risk assessment of strain-specific trends.

Translated title of the contribution	CPLP-TB:: a new tuberculosis transnational surveillance tool for the lusophone community
Original language	Portuguese
Pages (from-to)	87-90
Number of pages	4
Journal	Anais do Instituto de Higiene e Medicina Tropical
Volume	17
DOIs	https://doi.org/10.25761/anaisihmt.278
Publication status	Published - 2019

Keywords

CPLP
Tuberculose
Base de dados
Epidemiologia
Genotipagem
Tuberculosis
Database
Epidemiology
Genotyping

UN SDGs

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https://doi.org/10.25761/anaisihmt.278Licence: CC BY

CPLP-TB uma nova ferramenta de vigilância transnacionalFinal published version, 620 KBLicence: CC BY

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Perdigão, J., Silva, C., Diniz, J., Pereira, C., Machado, D., Ramos, J., Silva, H., Abilleira , F., Brum, C., Reis, A. J., Macedo, M., Scaini, J. L., Silva , A. B., Esteves, L. S., Macedo, R., Maltez, F., Clemente, S., Coelho, E., Viegas, S., ... Portugal, I. (2019). CPLP-TB: uma nova ferramenta de vigilância transnacional da tuberculose no espaço lusófono. Anais do Instituto de Higiene e Medicina Tropical, 17, 87-90. https://doi.org/10.25761/anaisihmt.278

@article{fbf49112c3d343b3be057e3818c0f57a,

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keywords = "CPLP, Tuberculose, Base de dados, Epidemiologia, Genotipagem, Tuberculosis, Database, Epidemiology, Genotyping",

author = "Jo{\~a}o Perdig{\~a}o and Carla Silva and Jaciara Diniz and Catarina Pereira and Diana Machado and Jorge Ramos and Hugo Silva and Fernanda Abilleira and Clarice Brum and Reis, {Ana J} and Ma{\'i}ra Macedo and Scaini, {Jo{\~a}o L} and Silva, {Ana B.} and Esteves, {Leonardo S.} and Rita Macedo and Fernando Maltez and Sofia Clemente and Elizabeth Coelho and Sofia Viegas and Paulo Rabna and Amab{\'e}lia Rodrigues and Nuno Taveira and Lu{\'i}sa Jord{\~a}o and Afr{\^a}nio Kritski and {Lapa E Silva}, {Jos{\'e} Roberto} and Igor Mokrousov and David Couvin and Nalin Rastogi and I Couto and Arnab Pain and Ruth McNerney and Clark, {Taane G.} and Groll, {Andrea von} and {Dalla Costa}, {Elis R.} and Rossetti, {Maria L{\'u}cia} and {da Silva}, {Pedro E Almeida} and M Viveiros and Isabel Portugal",

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issn = "0303-7762",

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Perdigão, J, Silva, C, Diniz, J, Pereira, C, Machado, D, Ramos, J, Silva, H, Abilleira , F, Brum, C, Reis, AJ, Macedo, M, Scaini, JL, Silva , AB, Esteves, LS, Macedo, R, Maltez, F, Clemente, S, Coelho, E, Viegas, S, Rabna, P, Rodrigues, A, Taveira, N, Jordão, L, Kritski, A, Lapa E Silva, JR, Mokrousov, I, Couvin, D, Rastogi, N, Couto, I, Pain, A, McNerney, R, Clark, TG, Groll, AV, Dalla Costa, ER, Rossetti, ML, da Silva, PEA, Viveiros, M & Portugal, I 2019, 'CPLP-TB: uma nova ferramenta de vigilância transnacional da tuberculose no espaço lusófono', Anais do Instituto de Higiene e Medicina Tropical, vol. 17, pp. 87-90. https://doi.org/10.25761/anaisihmt.278

TY - JOUR

T1 - CPLP-TB:

T2 - uma nova ferramenta de vigilância transnacional da tuberculose no espaço lusófono

AU - Perdigão, João

AU - Silva, Carla

AU - Diniz, Jaciara

AU - Pereira, Catarina

AU - Machado, Diana

AU - Ramos, Jorge

AU - Silva, Hugo

AU - Abilleira , Fernanda

AU - Brum, Clarice

AU - Reis, Ana J

AU - Macedo, Maíra

AU - Scaini, João L

AU - Silva , Ana B.

AU - Esteves, Leonardo S.

AU - Macedo, Rita

AU - Maltez, Fernando

AU - Clemente, Sofia

AU - Coelho, Elizabeth

AU - Viegas, Sofia

AU - Rabna, Paulo

AU - Rodrigues, Amabélia

AU - Taveira, Nuno

AU - Jordão, Luísa

AU - Kritski, Afrânio

AU - Lapa E Silva, José Roberto

AU - Mokrousov, Igor

AU - Couvin, David

AU - Rastogi, Nalin

AU - Couto, I

AU - Pain, Arnab

AU - McNerney, Ruth

AU - Clark, Taane G.

AU - Groll, Andrea von

AU - Dalla Costa, Elis R.

AU - Rossetti, Maria Lúcia

AU - da Silva, Pedro E Almeida

AU - Viveiros, M

AU - Portugal, Isabel

PY - 2019

Y1 - 2019

N2 - A Tuberculose (TB) permanece um grave problema de saúde pública na Comunidade dos Países de Língua Portuguesa (CPLP). Apesar da ampla variância da incidência da TB nos seus estados-membro e de um fluxo migratório contínuo entre os países que integram este grupo, existe uma enorme lacuna no que diz respeito ao conhecimento da estrutura populacional conjunta do Mycobacterium tuberculosis e circulação de estirpes entre estes países. Para fazer face a esta necessidade, foi agregado e analisado o maior conjunto de dados respeitante à diversidade genotípica e resistência fenotípica na CPLP que compreende um total de 1447 isolados clínicos, incluindo 423 isolados multirresistentes de cinco países da CPLP. Por forma a tornar estes dados disponíveis para a comunidade científica e autoridades de saúde pública, foi desenvolvida a CPLP-TB (disponível em http://cplp-tb.ff.ulisboa.pt), uma base de dados disponível online e provida de aplicativos para análise exploratória do conteúdo. Como ferramenta de saúde pública, espera-se que venha a contribuir para um conhecimento mais aprofundado da estrutura populacional do M. tuberculosis e circulação de estirpes na CPLP de forma a apoiar a avaliação de risco e tendências específicas para diversos clones.Tuberculosis (TB) remains a major health problem within the Community of Portuguese Language Speaking Countries (CPLP). Despite the marked variation in TB incidence across its member-states and continued human migratory flux between countries, a considerable gap in the knowledge on the Mycobacterium tuberculosis population structure and strain circulation between the countries still exists. To address this, we have assembled and analyzed the largest CPLP M . tuberculosis molecular and drug susceptibility dataset, comprised by a total of 1447 clinical isolates, including 423 multidrug-resistant isolates, from five CPLP countries. To make this data available to the scientific community and public health authorities we developed CPLP-TB (available at http://cplp-tb.ff.ulisboa.pt), an online database coupled with web-based tools for exploratory data analysis. As a public health tool, it is expected to contribute to improved knowledge on the M. tuberculosis population structure and strain circulation within the CPLP, thus supporting the risk assessment of strain-specific trends.

AB - A Tuberculose (TB) permanece um grave problema de saúde pública na Comunidade dos Países de Língua Portuguesa (CPLP). Apesar da ampla variância da incidência da TB nos seus estados-membro e de um fluxo migratório contínuo entre os países que integram este grupo, existe uma enorme lacuna no que diz respeito ao conhecimento da estrutura populacional conjunta do Mycobacterium tuberculosis e circulação de estirpes entre estes países. Para fazer face a esta necessidade, foi agregado e analisado o maior conjunto de dados respeitante à diversidade genotípica e resistência fenotípica na CPLP que compreende um total de 1447 isolados clínicos, incluindo 423 isolados multirresistentes de cinco países da CPLP. Por forma a tornar estes dados disponíveis para a comunidade científica e autoridades de saúde pública, foi desenvolvida a CPLP-TB (disponível em http://cplp-tb.ff.ulisboa.pt), uma base de dados disponível online e provida de aplicativos para análise exploratória do conteúdo. Como ferramenta de saúde pública, espera-se que venha a contribuir para um conhecimento mais aprofundado da estrutura populacional do M. tuberculosis e circulação de estirpes na CPLP de forma a apoiar a avaliação de risco e tendências específicas para diversos clones.Tuberculosis (TB) remains a major health problem within the Community of Portuguese Language Speaking Countries (CPLP). Despite the marked variation in TB incidence across its member-states and continued human migratory flux between countries, a considerable gap in the knowledge on the Mycobacterium tuberculosis population structure and strain circulation between the countries still exists. To address this, we have assembled and analyzed the largest CPLP M . tuberculosis molecular and drug susceptibility dataset, comprised by a total of 1447 clinical isolates, including 423 multidrug-resistant isolates, from five CPLP countries. To make this data available to the scientific community and public health authorities we developed CPLP-TB (available at http://cplp-tb.ff.ulisboa.pt), an online database coupled with web-based tools for exploratory data analysis. As a public health tool, it is expected to contribute to improved knowledge on the M. tuberculosis population structure and strain circulation within the CPLP, thus supporting the risk assessment of strain-specific trends.

KW - CPLP

KW - Tuberculose

KW - Base de dados

KW - Epidemiologia

KW - Genotipagem

KW - Tuberculosis

KW - Database

KW - Epidemiology

KW - Genotyping

UR - http://anaisihmt.com/index.php/ihmt/article/view/278

U2 - https://doi.org/10.25761/anaisihmt.278

DO - https://doi.org/10.25761/anaisihmt.278

M3 - Article

SN - 0303-7762

VL - 17

SP - 87

EP - 90

JO - Anais do Instituto de Higiene e Medicina Tropical

JF - Anais do Instituto de Higiene e Medicina Tropical

ER -